健康科普医学遗传篇8流产组织的基因检

流产组织的基因检测

流产的发生率约为10%～18%，不仅影响妇女健康，甚至可因急性出血或严重感染而威胁妇女生命。根据流产发生的孕周可分为早期流产（孕12周以前）和晚期流产（孕12周后～28周）。早期流产占自然流产的80%，而早期流产中约60%是因为胚胎染色体异常导致。

我们采用低深度全基因组测序方法（CNV-seq）对全基因组范围内染色体异常进行检测，对流产物进行染色体异常检测可排查是否为胎儿染色体异常导致的流产，进而科学指导下次备孕，减少流产的风险。

CNV的定义

CNV（Copynumbervariation,拷贝数变异）是人类遗传病的一大重要原因，CNV是由基因组发生重排而导致的，相对于二倍体基因组来说，一般指长度为1Kb以上的基因组大片段拷贝数增加或减少，包括重复、丢失、倒位及易位，主要表现为亚显微水平的缺失或重复。而常提及的狭义拷贝数变异指的是基因拷贝数目的改变。除此之外，基因组上也会发生涉及大片段DNA的变异，但不会改变DNA片段拷贝数的变异，例如倒位（Inversion）和平衡易位（Balancedtranslocation）等。此类不改变DNA片段拷贝数的变异和CNV一起被统称为基因组结构变异（Structuralvariation,SV）。

CNV的致病机制及检测

CNV的形成机制有多种，可分为DNA重组和DNA错误复制两大类。CNV可引起单基因病与罕见病，同时与复杂疾病也相关。其致病的可能机制有基因剂量效应、基因断裂、基因融合和位置效应等。

致病的CNV与许多常见的和罕见的疾病有关联，包括自闭症、精神分裂症、智力障碍、多种先天性畸形和特定形式的听力损失等。

目前检测CNV技术包括荧光原位杂交（FISH）、荧光定量聚合酶链式反应（qPCR）、多重连接探针扩增技术（MLPA）、单核苷酸多态性基因芯片（SNParray）及发展迅猛的高通量测序技术（NGS）等。借助于新一代测序技术和相应的策略可以对CNV进行发掘和精确定位。

流产组织检测适用人群

技术优势

1、可实现三倍体的检测，通过SNP位点频率分析可弥补普通CNV-seq无法检测三倍体的缺陷；

2、PCR-free建库，无扩增偏好性；

3、与G显带核型分析技术相比，CNV-seq无需细胞培养，具有报告周期短、分辨率高等优势；

4、与比较基因组芯片（ArrayCGH）技术相比，具有所需样本量更少、不受探针位置影响，检测范围更广的优势。

接收样本类型及要求

CNV遗传咨询面临的挑战

一些发病率较高、临床表型易辨识的综合征已能被临床及遗传学医师鉴别。但是人类基因组中存在着大量的基因组结构变异，而致病性尚未完全明确，仍需大量的研究来发现致病性变异。将基因组疾病的检测应用到临床仍然面临着巨大的挑战。对CNV这类遗传变异的系统性研究，或将可以促进相关人类疾病的发病机制认识，指导疾病的分子诊断和新的治疗手段的开发。

供稿：医学遗传科冯杏琳

扫

转载请注明：http://www.lvxshes.com/dzjxjc/14194.html